日暮戈薇是一个15岁的普通女孩，在读初中三年级。有一天，她偶然通过自己神社里的枯井，来到了500年前的战国时代。当狼烟四起，妖魔鬼怪横行，人间大地尽毁。葛伟在神木遇见了被封印的半妖犬夜叉。五十年前，想成为真正怪物的犬夜叉为了得到四魂之玉，结识了拥有强大精神力量的女巫桔梗。经过一段时间的相处，他们之间产生了感情。犬夜叉因此希望成为一个人，桔梗也打算在净化了四魂之玉后回归普通人的生活。然而，对桔梗怀有恶念的小偷鬼蜘蛛却将自己的灵魂和身体交给了桔梗，然后化身为的半妖奈落。在他的挑衅下，犬夜叉被桔梗封印在神木上，重伤的桔梗也在悲痛和绝望中死去。

桔梗转世葛微救了犬夜叉，却不小心把四魂之玉射成了碎片。为了找回碎片，她和犬夜叉以及他们后来的伙伴:七宝、弥勒和珊瑚踏上了充满艰难险阻的旅程...