2029年3月的一天，某国 美国大被一群经历了大规模重建的武装分子入侵，许多外国使节和他们的同行 一些家庭被扣为。情况很紧急。草籽(坂本真绫配音)召集巴特(松本一郎田健配音)、托古萨(新垣樽助配音)等得力部下，制定了周密的营救计划。没想到，就在一切都按计划进行时，意外突然发生了。与此同时，在离大不远的一栋摩天大楼里，日本首相被一枚锁箱炸弹，紫苏前老板库鲁兹(浅野麻由美)也在爆炸中丧生。经过仔细追查，紫苏等人发现一种可以篡改记忆的病毒正在互联网上传播，她的人生经历与一系列事件息息相关。目前，危机、阴谋悄然死灰复燃...

这部电影改编自士郎正宗 的同名原著，是纪念《攻壳机动队》 ;的诞生。