存放在大内的武功秘籍《《葵花宝典》》被盗。掌管东厂的顾九福(刘顺饰)带领欧阳权(张学友饰)等千户，南下调查锦衣卫林震南辞职一事，同时接受五岳教主左冷禅(元华饰)的对外协调。华山派大令狐冲(许冠杰饰)与华山派妹妹岳灵珊(叶童饰)奉师门之命前往增援林震南，却无可奈何。收到林震南 遗嘱，他们逃走了。途中遇到刘正风(午马)、日月神道长老曲阳(林正英)、华山派冯清扬，交给《笑傲江湖》 ;的乐谱和独孤九剑。

各界人士齐聚苗疆为《葵花宝典》造势，欧阳权、左冷禅居功，于是他假扮林平之，加入了华山派。令狐冲结识了任盈盈(张敏饰)和蓝凤凰(袁洁莹饰)，他们是日月神道教的信徒，并得到了曲阳的帮助。古今傅和为而战，但不忍一众师兄弟之怒，用独孤九剑悟出了 "笑傲江湖 "。

这部电影是根据金庸小说改编的。;的同名小说。